往日之影有两种不同的路线玩法，分别是帮助黑客百灵鸟逃跑路线，以及帮助特工李德抓捕百灵鸟的路线。这两条路线分别会解锁不同的结局，在游戏中后期主线任务推进到审判日，在跟狗镇大boss汉森进行会面时将会迎来第一个转折点。此时有两个选项，帮助百灵鸟逃跑或者帮助李德抓住百灵鸟，如果选择帮助百灵鸟逃跑就会带着她杀出一片血路，直到杀出狗镇乘坐飞船逃离前往月球。
带着百灵鸟一路逃到火车站时就会迎来结局的选择，此时百灵鸟奄奄一息，可以选择把她交给李德或者带着逃跑，如果选择继续逃跑就能达成结局一。如果把百灵鸟交给李德就会触发结局二，主角身体被治疗好了，但是变回普通人无法使用义体。李德路线是审判日帮助抓住百灵鸟，路线会变成抓捕百灵鸟，不仅要面对魔化的百灵鸟还要硬刚暴恐机动队。
在主线直到大厦崩塌找到百灵鸟，就会迎来结局的选择，选择杀死百灵鸟触发结局三，百灵鸟遗体被带走，主角身体没有被治疗而是给了五千块大洋奖励。不杀百灵鸟的话会被带回去治疗，并且承诺会治好身体，但治疗之后跟结局二一样变回普通人。可以在天台跟银手对话时，直接选择不治疗了，这样虽然不能完成任务，但是结局所有人都会存活。隐藏结局是初到狗镇的时候，总统飞机降落选择不去救，这样就不会有后续的剧情直接结局了。
